美国政府对爱泼斯坦案的调查处理方式，导致美国司法部和联邦调查局（FBI）官员产生分歧。报道称7月11日，FBI副局长邦吉诺曾与司法部长邦迪就此案产生“激烈冲突”，正考虑辞职。FBI局长帕特尔否认将因此案辞职，另有司法部官员否认了两个部门由此案出现裂痕的说法。据《卫报》7月13日报道，帕特尔表示，有关“FBI希望公布更多信息但被司法部拦住”的“阴谋论不是真的，很荣幸能为美国总统效劳，只要他需要，我就会继续这么做。”（参考消息）